鸭场可根据本地区和本场疾病发生情况，适时、适度地引入疫苗进行免疫，例如在鸭肝炎的高发区或受肝炎威胁的地区就必须进行鸭传染性肝炎的免疫。
疫苗免疫，对鸭群本身是一种应激，为了减小这种应激，可在饲料或饮水中添加多维电解质。不同季节，免疫接种要注意必要的细节问题。使用油乳剂灭活疫苗时，先要将疫苗恢复至室温，否则注射到皮下的疫苗形成疫苗团而不易吸收；夏季气候炎热，疫苗接种时，首先要保证充足的饮水，并且尽量将免疫时间安排在清晨凉爽的时候。免疫中，要不断摇匀疫苗，使每只鸭都能获得等量有效的抗原免疫。接种组织弱毒苗时，免疫全程时间最好控制在1个半小时内，以防疫苗在温度过高的鸭舍中长时间暴露而影响病毒的免疫活性。